| 主要寄生部位 | 虫名 | 科(Family) | 目(Order) | 纲(Class) |
| 单核吞噬系统 | 杜氏利什曼原虫Leishmania donouani | 锥虫科Trypanosomatidae | 动基体目Kinetoplastida | 动鞭纲Zoomastigophora |
| 热带利什曼原虫Leishmania tropica | ||||
| 巴西利什曼原虫Leishmania braziliensis | ||||
| 血液 | 锥虫Trypanosoma sp. | |||
| 泌尿生殖道 | 阴道毛滴虫Trichomonas uaginalis | 毛滴虫科Trichomonadidae | 毛滴虫目Trichomonadida | |
| 口腔 | 口腔毛滴虫Trichomonas tenax | |||
| 肠 | 人毛滴虫Trichomonas hominis | |||
| 脆双核阿米巴Dientamoeba fragilis | ||||
| 蓝氏贾第鞭毛虫Giardia lamblia | 六鞭毛科Hexamitidae | 双滴虫目Diplomonadida | ||
| 梅氏唇鞭毛虫Chilomastix mesnili | 曲滴虫科Retortamonadidae | 旋滴虫目Retortamonadida | ||
| 溶组织内阿米巴Entamoeba histolytica | 内阿米巴科Entamoebidae | 阿米巴目Amoebida | 叶足纲Lobosea | |
| 哈门氏阿米巴Entamoeba hartmani | ||||
| 结肠内阿米巴Entamoeba coli | ||||
| 布氏嗜碘阿米巴Iodamoeba butschlii | ||||
| 微小内蜒阿米巴Endolimax nana | ||||
| 口腔 | 齿龈内阿米巴Entamoeba gingivalis | |||
| 脑(等) | 棘阿米巴Acanthamoeba sp. | 棘阿米巴科Acanthamoebidae | ||
| 福氏耐格里阿米巴Naegleria fowleri | 双鞭阿米巴科Dimastiamoebidiae | |||
| 红细胞 | 间日疟原虫Plasmodium vivax | 疟原虫科Plasmodidae | 真球虫目Eucoccidiida | 孢子纲Sporozose |
| 三日疟原虫Plasmodium malariae | ||||
| 恶性疟原虫Plasmodium falciparum | ||||
| 卵形疟原虫Plasmodium ovale | ||||
| 巴贝虫Babesia sp. | 巴贝虫科Babesidae | 梨浆虫目Piroplasmida | ||
| 肺泡 | 卡氏肺孢子虫Pneumocystis carinii | 未定 | 真球虫目Eucoccidiida | |
| 有核细胞 | 刚地弓形虫Toxoplasma gondii | 弓形虫科Toxoplasmatidae | ||
| 组织 | 肉孢子虫Sarcocystis sp. | 肉孢子虫科Sarcocystidae | ||
| 等孢子虫Isospora sp. | 爱美虫科Eimeriidae | |||
| 隐孢子虫Cryptosporidium sp. | 隐孢子虫科Cryptosporidae | |||
| 结肠 | 结肠小袋纤毛虫Balantidium coli | 小袋科Balantidiidae | 毛口目Trichostomatida | 动基裂纲Kinetofragminophorea |